哪里能治愈白癜风 http://pf.39.net/bdfyy/dbfzl/160319/4793220.htmlJuly19,Online研究表明,小麦D 因组有更低的抑制性组蛋白修饰和 化,这一定程度上揭示了D 因组在表达上的优势。为了进一步研究在染色质可及性上表观与表达差异的关系,使用MNase-seq的方法检测了小麦的染色质状态(什么是MNase-seq?)。根据DNS(DifferentialNucleaseSensitivity)score,利用iSeg工具得到MSF(MNasehyper-sensitivefootprints)或MRF(MNasehyper-resistantfootprints)区域。D 因组平均DNS显著高于A和B。染色体两端区域(R1和R3)比中间区域(R2a/R2b/C)的DNS高,MSF区域在R1和R3富集,MRF在R2a/R2b/C富集。67%的MSF和91%的MRF定位在TE上,TE中的MRF相比于MSF更加富集,但具体各类型TE的富集情况不同。增强子区域的染色质可及性与基因表达正相关:分析共计对同源基因7种表达状态下三套 因组对应基因的上下游区域DNS情况,发现对于表达平衡的基因对来说,三套 因组基因上下游的DNS也无显著差异。表达存在dominance或者suppression的基因对来说,DNS在三套 因组上会存在显著差异。TE密度与DNS显著负相关:可用来解释遗传变异的SNP更多富集在染色质开放区域:以上只截了一部分结果,大致分析是 步计算全基因组范围内的DNS,然后与各种遗传成分(基因区间、基因间区、TE等等)找相关性, 因组之间再比较,找到小麦染色质可及性的一些显著性结果,分析方法和结论不是很重要,很多都是预期之内的,重要性在于是多倍体小麦 次做MNase-seq。参考文献:Jordan,K.W.,He,F.,deSoto,M.F.etal.Differentialchromatinaccessibilitylandscaperevealsstructuralandfunctionalfeaturesoftheallopolyploidwheatchromosomes.GenomeBiol21,().