小麦多组学网站更新中国春21资源

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尽管目前网站上已经上线中国春2.1版本的基因组以及基因组,但由于新版本的基因编号03G与以往编号的对应不能在通过数字一一对应,在实际使用中还存在不便。另外,最近课题组的同学们也用这一需求,加上陆续有部分老师同学提出这点。所以我还是加班进行了更新,希望可以解决部分问题。如果你看不到更新,请清理浏览器最近一小时的缓存。1GeneHub更新目前支持01G/02G/03G基因ID的搜索,不是转录本ID。如TraesCS1A03G.1是转录本的ID,基因ID注意需要去掉"."以及后面的数字,是TraesCS1A03G。友情提醒:大家千万不要搞错,尤其是不要认为TraesCS1A03G.1和TraesCS1A03G.2是两个基因,甚至是一个基因的两个拷贝。GeneHub是非常核心的存在,只要到达这个页面,很多本站以及外站资源将一键直达。记住这一点,将省很多事。比如,HomologFinder目前不支持03G,要怎么样才能获得同源基因?答案通过上方的搜索框搜索03G基因ID,进入返回页面后,所有信息会迎面而来,可谓一秒直达。这里就不展示页面了,结果太多,截图太长。2IntervalTool和Pfam工具更新现在可以方便的调取2.1版本某个基因组区间的基因了。注意,03G的功能注释与PFAM结果来自01G。3JBrowse更新2.1版本的JBrowse目前支持03G以及02G转录本ID的搜搜。03G版本的基因注释使用eggNOG数据库注释。另外,NCBI也对2.1版本的基因组进行了基因注释,我们也加到JBrowse中了,可作为补充。Onemorething...

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